朱熹的不受重视，还要从南宋的官斗说起，随着朱熹在学术圈的名头越来越大，他成功地引起了皇帝宋宁宗的注意，朱熹升职为宁宗的老师。但朱熹这人，自己讲理学，还要认死理，严格刻板得很，经常对宁宗进行批评教育。宁宗受不了了，让朱熹回家养老去了。 虽说人家处理得很好，但是官场上可有人不乐意了，官场上有两个人，一个叫赵汝愚，一个叫韩侂胄，其中赵汝愚是朱熹理学铁杆粉丝，这就让韩侂胄找到了理由，借着攻击赵汝愚的由头攻击朱熹。造谣朱熹不孝，给母亲吃糙米（实际上朱熹是因为穷，因为朱熹学生众多，穷得只能养起学生了）；给皇帝建言献策说成不尊重皇帝的表现，然而这是因为朱熹主张“正君心”，儒生要帮助皇帝培育德行，因此才向皇帝大胆进言献策，结果这也成了朱熹的黑点。 最严重的一条就是“存天理，灭人欲”，然而这句话并不是朱熹原话，是后人解读以后给极端化了， 朱熹的意思是什么：“饮食，天理也，山珍海味，人欲也；夫妻，天理也，三妻四妾，人欲也”。吃饱，这叫天理，吃山珍海味、铺张浪费，这叫人欲；夫妻，这叫天理，左拥右抱一大堆老婆，这叫人欲。好好的一句不要铺张浪费，不要成为海王，让人解读成任何人类正常的欲望都不要有，这是对朱熹言论一个比较大的污蔑。 话虽如此，因为理学有利于管理老百姓，所以统治者们都喜欢这套玩法，之后的元明清三个朝代都是这样。逐渐地，儒学也恢复了从前的正统地位。